Retourne au Fort de Guet et tu apprends bien vite que des rumeurs disent que la princesse Zelda a été vue au Château d'Hyrule. Dorénavant des gardes gerudos surveillent le fort. Va parler à Pru'ha sur le toit de sa maison. Lors d'une lune de sang, tu aperçois brièvement Zelda devant le château qui flotte dans les airs. Pru'ha te demande alors de te rendre au Château d'Hyrule. En ayant des plats enduro pour remplir une à deux jauges d'endurance (selon ton niveau d'endurance actuel), utilise la tour de reconnaissance pour t'envoler dans les airs, puis dirige-toi vers le côté est du Château d'Hyrule. Pendant ton vol, fais appel à Babil pour qu'il te donne des coups de boost. Quand tu aperçois un sanctuaire plus bas devant toi, atterris près de lui et entre...
Sanctuaire Seltabo Mati
Avance, saisis la plaque, pose-la sur les deux pieux dans le mur, puis utilise Rétrospective pour grimper. Saisis la petite plaque plus loin, colle-la à angle droit à l'autre, puis place la grande plaque à la verticale avec la petite posée sur le pieu. Utilise Rétrospective pour grimper. Ensuite, fais la même chose, et colle encore une petite plaque à l'autre petite plaque. Place le tout par-dessus les piques, puis utilise Rétrospective pour grimper vers le coffre. Ouvre-le pour une baguette magique, puis saute et détache la grande plaque des deux petites. Pose la grande plaque sur les deux pieux, grimpe avec Rétrospective, puis saisis les deux petites et place-les en diagonale vers l'autel. Grimpe et reçois une autre lueur bienfaisante.
Avant de poursuivre, tu peux choisir de retourner au Fort de Guet pour préparer des plats, notamment un plat solaris qui soigne les coeurs blessés par les miasmes. Tu peux aussi rendre visite à une grande fée pour améliorer tes vêtements et échanger des noix avec Noïa pour agrandir ta sacoche.
En sortant, dirige-toi vers le sud, grimpe le long des parois, cours et vole vers la tour où se trouve le point cible. Puis saute plus bas où se trouve Zelda. Quand tu t'approches, elle disparaît à nouveau et laisse place à une horde de Bokoblins, dont un Chef boko noir. Combats tous ces ennemis avec l'aide des avatars des sages, puis ramasse les cornes de Chef boko noir, les viscères de Chef boko et autres matériaux et armes.
La localisation de Zelda se trouve maintenant au 3ème sous-sol du château. Repars vers le nord, puis vole plus bas jusqu'à un groupe de Moblins noirs, puis regarde en bas vers l'extérieur du château pour apercevoir un couloir. Vole jusque là pour arriver dans la bibliothèque. Zelda se trouve au centre de cette grande pièce. Et à nouveau elle laisse place à un groupe de monstres dont un Hinox noir ! Après avoir vaincu ces ennemis, ramasse les matériaux de l'Hinox noir comme sa corne d'Hinox noir, puis fouille la bibliothèque pour y trouver des armes. Déplace un pan de bibliothèque derrière laquelle se trouve un coffre avec une Dracoroche d'Ordrac. Déplace un autre pan de bibliothèque au nord pour entrer dans l'Étude du Roi où tu trouves un coffre contenant les bottes de garde royal. un bouclier royal et une épée royale. Continue vers le nord où tu retrouves Zelda qui laisse place à des Gibdos, puis elle s'enfuit au premier sous-sol.
Continue vers le nord pour sortir, puis va vers l'ouest. Combats ou évite les Troglobins, puis lorsque tu vois un Like Like de glace, grimpe sur ta droite et monte les marches vers le premier sous-sol. Monte encore un escalier, puis arrivé devant l'entrée bloquée de la pièce suivante, utilise Infiltration pour grimper au rez-de-chaussée, puis saute dans la salle où se trouve Zelda. Cette fois ce sont trois Lézalfos de feu. Attaque-les, puis trouve le béret de garde royal dans un coffre derrière un paravent et prend l'arc de garde royal au-dessus de la cheminée. Dans la petite pièce à côté se trouve un espadon de garde royal. Sors sur le balcon et vole vers la muraille, puis va plus bas où tu vois un Hinox noir, et saute encore plus bas au 3ème sous-sol.
Entre dans la pièce où se trouve la princesse. Débarrasse-toi des chauves-souris de glace et du Moblin d'argent, ramasse sa corne de Moblin d'argent, puis utilise Infiltration pour grimper au 2ème sous-sol à l'extérieur. Combats ou contourne le Like Like de glace, puis avance, descends l'escalier en colimaçon à l'ouest et tourne à gauche. C'est au tour de trois Like Like électriques ! Sois prudent et élimine-les un à un. Prends leurs gastrolithes d'Électrolike et éventuellement les boucliers et arc laissés. Puis tu entends à nouveau la voix de Zelda.
Reprends l'escalier en colimaçon, repars au nord et reviens au premier sous-sol. Monte l'escalier, retourne dans les Appartements de Zelda (où étaient les Lézalfos de feu), puis dirige-toi vers le centre du château où t'attend Zelda. Arrivé dans les quartiers principaux, Zelda a un comportement étrange et un petit sourire mauvais... Alors apparaît un monstre momie qui rappelle Ganondorf... Celui-ci est surpris de voir que tu es arrivé aussi loin... Il t'envoie le fruit de sa chair :
Le Fantôme de Ganon - Ombre conjurée du Roi Démon
Lors de la première phase le Fantôme de Ganon fait apparaître quatre clones. A l'aide de tes compagnons, concentre-toi plutôt sur ces clones et sur un en particulier, tout en surveillant tes arrières. Les esprits des sages t'aident à ne pas être dépassé. Sois toujours très mobile. Frappe-le avec ta meilleure arme, puis lorsqu'il est vaincu, ramasse son sabre miasmatique et son arc miasmatique, des armes puissantes. Equipe alors ces armes pour t'attaquer aux autres clones. Essaie de bloquer leurs attaques avec ton bouclier pour enchaîner une frappe. Lorsque les clones sont vaincus, attaque-toi au fantôme.
Lorsqu'il a perdu la moitié de sa vie, la seconde phase démarre. Le fantôme appelle à nouveau quatre clones, puis il va commencer à répandre du miasme dans la salle. Essaie de le toucher rapidement avant de perdre trop de coeurs. Quand il y a trop de miasmes, tire des flèches sur leurs têtes. Après quelques coups, les miasmes disparaissent, reprends alors vite le combat à l'épée. Dans cette phase, les fantômes changent souvent d'armes, sois très prudent et ramasse-les également dès que tu peux. Ensuite, le Fantôme de Ganon s'apprête à t'achever, mais tes compagnons s'interposent et le font abandonner. Pour autant, Ganondorf lance une puissante armée de différents monstres sur Hyrule et promet de revenir bientôt !
Prends le Réceptacle de Coeur, puis va près du trône et trouve la nouvelle tunique de Prodige !